MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 8551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013199	CTATTA	2	12	1463	1474	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_013199	TATAT	2	10	1487	1496	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013199	AT	4	8	1493	1500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013199	ACG	2	6	1504	1509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013199	AGG	2	6	1513	1518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013199	A	6	6	2695	2700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013199	T	6	6	2730	2735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013199	TCC	2	6	2959	2964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_013199	GCAA	2	8	2987	2994	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013199	ATT	2	6	3024	3029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013199	TAA	2	6	3035	3040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013199	TTTA	2	8	3045	3052	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013199	TAAAA	2	10	3091	3100	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013199	GAT	2	6	3127	3132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013199	T	6	6	3176	3181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013199	TAGGC	2	10	3302	3311	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013199	G	6	6	3371	3376	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013199	T	6	6	3428	3433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013199	TAAT	2	8	3450	3457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013199	TGG	2	6	3488	3493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013199	GAG	2	6	4874	4879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013199	GAG	2	6	6894	6899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013199	CAT	2	6	9670	9675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013199	AAAT	2	8	9866	9873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013199	T	6	6	9891	9896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013199	AAC	2	6	9950	9955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013199	GTT	2	6	9977	9982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013199	AAAAT	2	10	10024	10033	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013199	T	6	6	10059	10064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013199	TTA	2	6	10091	10096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013199	TAT	2	6	10109	10114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013199	T	7	7	10120	10126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013199	GAAA	2	8	10128	10135	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013199	TTA	2	6	10151	10156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013199	A	6	6	10193	10198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013199	GTA	2	6	10449	10454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013199	T	6	6	10497	10502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013199	AGA	2	6	10503	10508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013199	A	6	6	10515	10520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013199	GGT	2	6	11063	11068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013199	ATT	2	6	11120	11125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013199	AGT	2	6	11811	11816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013199	TTA	2	6	11876	11881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013199	AGG	2	6	11921	11926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013199	AGG	2	6	12931	12936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013199	T	7	7	13226	13232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013199	AT	3	6	13999	14004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013199	AT	3	6	14145	14150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013199	TA	3	6	14199	14204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013199	ATTTG	2	10	14208	14217	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013199	AGG	2	6	14238	14243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013199	ATA	2	6	16786	16791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013199	AGG	2	6	16806	16811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013199	A	6	6	17038	17043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013199	CTAA	2	8	17049	17056	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_013199	CA	3	6	17079	17084	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013199	GTA	2	6	17534	17539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013199	TGA	2	6	17552	17557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013199	ATT	2	6	17567	17572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013199	TTTA	2	8	17664	17671	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013199	ACG	2	6	17735	17740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013199	GTT	2	6	17834	17839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013199	AGCAG	2	10	17947	17956	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_013199	ATT	2	6	18071	18076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013199	ATA	2	6	18077	18082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013199	AAG	2	6	18136	18141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013199	A	7	7	18207	18213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013199	T	7	7	18279	18285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013199	ATTT	2	8	18304	18311	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013199	T	6	6	18325	18330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013199	ATAC	2	8	19093	19100	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_013199	AGTG	2	8	19195	19202	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013199	A	7	7	19213	19219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013199	ATTC	2	8	19226	19233	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_013199	CAG	2	6	19266	19271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013199	TTTC	2	8	21043	21050	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_013199	T	6	6	21085	21090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013199	TCT	2	6	21195	21200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013199	AAT	2	6	21202	21207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013199	TCA	2	6	21215	21220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013199	AT	3	6	21239	21244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013199	GGC	2	6	21265	21270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013199	AAT	3	9	21295	21303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013199	AAC	2	6	21322	21327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013199	CTG	2	6	21370	21375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013199	GGGC	2	8	21389	21396	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
87	NC_013199	CAA	2	6	21405	21410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013199	TGCG	2	8	21431	21438	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_013199	TCC	2	6	21452	21457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_013199	ATG	2	6	21475	21480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013199	CAA	2	6	21483	21488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013199	TTG	2	6	21608	21613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013199	AC	3	6	21626	21631	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_013199	TTTG	2	8	21652	21659	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013199	GGC	2	6	21696	21701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013199	AGG	2	6	23968	23973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013199	A	6	6	24044	24049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013199	GTT	2	6	24079	24084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013199	TTAT	2	8	24092	24099	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013199	GGGT	2	8	24156	24163	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013199	TTAA	3	12	25434	25445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013199	GTT	2	6	25500	25505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013199	A	6	6	25579	25584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013199	CCT	2	6	28912	28917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_013199	GTT	2	6	28966	28971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013199	TAA	2	6	28976	28981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013199	TGT	2	6	29030	29035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013199	GCC	2	6	29637	29642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_013199	ATG	2	6	30867	30872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013199	CGC	2	6	30917	30922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_013199	GCG	2	6	30943	30948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013199	TTGC	2	8	30952	30959	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_013199	TGC	2	6	31764	31769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013199	TCA	2	6	31866	31871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_013199	AAG	2	6	31912	31917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013199	ACG	2	6	32531	32536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013199	AT	3	6	32548	32553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013199	TGA	2	6	32586	32591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013199	ATC	2	6	32605	32610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013199	T	6	6	32621	32626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013199	CAAA	2	8	32715	32722	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_013199	TAAAGG	2	12	32761	32772	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013199	CAA	2	6	33791	33796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_013199	GAT	2	6	33799	33804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013199	GTAT	2	8	33809	33816	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013199	AG	3	6	33837	33842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013199	T	6	6	33889	33894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013199	A	6	6	33932	33937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013199	AC	3	6	35460	35465	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_013199	TCA	2	6	35503	35508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013199	AGAA	2	8	35554	35561	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013199	TCT	2	6	35564	35569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013199	GATTT	2	10	36316	36325	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013199	TTG	2	6	36396	36401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013199	CAG	2	6	36434	36439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_013199	GTTT	2	8	36454	36461	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013199	AAG	2	6	36492	36497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013199	TA	3	6	36519	36524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013199	TTAAT	2	10	36531	36540	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013199	AAT	2	6	36646	36651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013199	TGT	2	6	37251	37256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013199	AAGT	2	8	37262	37269	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013199	CCGG	2	8	37296	37303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_013199	GTT	2	6	37356	37361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013199	TCG	2	6	37362	37367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_013199	AG	4	8	37482	37489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013199	TGA	2	6	37497	37502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013199	AAC	2	6	37551	37556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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297	NC_013199	AAC	2	6	86758	86763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_013199	T	6	6	86791	86796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_013199	TTA	2	6	86926	86931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_013199	AAAT	2	8	86962	86969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_013199	AGGT	2	8	88511	88518	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
302	NC_013199	GGA	2	6	92417	92422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
303	NC_013199	CAT	2	6	94728	94733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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305	NC_013199	TAT	2	6	94861	94866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
306	NC_013199	TTTA	2	8	94876	94883	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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309	NC_013199	AAG	2	6	95200	95205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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314	NC_013199	CTT	2	6	99893	99898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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321	NC_013199	TG	3	6	102199	102204	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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329	NC_013199	AGG	2	6	107034	107039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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331	NC_013199	TGA	2	6	107950	107955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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333	NC_013199	CT	3	6	108002	108007	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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339	NC_013199	T	7	7	108453	108459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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341	NC_013199	AAAAC	2	10	109228	109237	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
342	NC_013199	T	6	6	109251	109256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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345	NC_013199	TCC	2	6	114502	114507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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433	NC_013199	ATT	2	6	139832	139837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_013199	A	6	6	139933	139938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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436	NC_013199	ATT	2	6	140007	140012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_013199	AGC	2	6	154498	154503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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469	NC_013199	ACC	2	6	158434	158439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
470	NC_013199	AGG	2	6	158462	158467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
471	NC_013199	GCAAG	2	10	158477	158486	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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473	NC_013199	A	6	6	158576	158581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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480	NC_013199	CACC	2	8	159013	159020	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
481	NC_013199	TCCC	2	8	160027	160034	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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